Protein–RNA interactions for Protein: Q148W0

Atp8b1, Phospholipid-transporting ATPase IC, mousemouse

Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b1Q148W0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Atp8b1Q148W0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Atp8b1Q148W0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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