Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
StumQ0VBF8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms