Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms