Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms