Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms