Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms