Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms