Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx1P81068 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Irx1P81068 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Irx1P81068 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Irx1P81068 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx1P81068 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx1P81068 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx1P81068 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx1P81068 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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