Protein–RNA interactions for Protein: P70426

Rit1, GTP-binding protein Rit1, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rit1P70426 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rit1P70426 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rit1P70426 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rit1P70426 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rit1P70426 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rit1P70426 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rit1P70426 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rit1P70426 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rit1P70426 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rit1P70426 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rit1P70426 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rit1P70426 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rit1P70426 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rit1P70426 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rit1P70426 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rit1P70426 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rit1P70426 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rit1P70426 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rit1P70426 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rit1P70426 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rit1P70426 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rit1P70426 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rit1P70426 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rit1P70426 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rit1P70426 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rit1P70426 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rit1P70426 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rit1P70426 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rit1P70426 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rit1P70426 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rit1P70426 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rit1P70426 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rit1P70426 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rit1P70426 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rit1P70426 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rit1P70426 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rit1P70426 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rit1P70426 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rit1P70426 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rit1P70426 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms