Protein–RNA interactions for Protein: P61164

Actr1a, Alpha-centractin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr1aP61164 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actr1aP61164 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms