Protein–RNA interactions for Protein: P61148

Fgf1, Fibroblast growth factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf1P61148 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgf1P61148 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgf1P61148 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgf1P61148 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgf1P61148 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgf1P61148 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgf1P61148 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgf1P61148 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgf1P61148 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgf1P61148 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgf1P61148 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgf1P61148 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgf1P61148 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms