Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CckbrP56481 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CckbrP56481 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckbrP56481 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckbrP56481 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckbrP56481 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckbrP56481 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CckbrP56481 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CckbrP56481 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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