Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GferP56213 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
GferP56213 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GferP56213 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GferP56213 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
GferP56213 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GferP56213 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
GferP56213 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GferP56213 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GferP56213 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GferP56213 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GferP56213 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GferP56213 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GferP56213 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GferP56213 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GferP56213 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GferP56213 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GferP56213 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GferP56213 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GferP56213 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GferP56213 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GferP56213 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
GferP56213 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GferP56213 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GferP56213 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GferP56213 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GferP56213 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GferP56213 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GferP56213 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GferP56213 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GferP56213 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GferP56213 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GferP56213 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GferP56213 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GferP56213 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GferP56213 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GferP56213 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GferP56213 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GferP56213 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GferP56213 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GferP56213 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GferP56213 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GferP56213 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GferP56213 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GferP56213 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GferP56213 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GferP56213 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GferP56213 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GferP56213 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GferP56213 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GferP56213 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GferP56213 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GferP56213 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GferP56213 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GferP56213 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GferP56213 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GferP56213 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GferP56213 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
GferP56213 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GferP56213 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
GferP56213 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GferP56213 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GferP56213 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GferP56213 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GferP56213 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GferP56213 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GferP56213 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GferP56213 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GferP56213 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GferP56213 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GferP56213 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GferP56213 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GferP56213 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GferP56213 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GferP56213 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GferP56213 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GferP56213 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GferP56213 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GferP56213 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GferP56213 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GferP56213 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
GferP56213 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
GferP56213 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GferP56213 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GferP56213 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GferP56213 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GferP56213 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GferP56213 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GferP56213 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GferP56213 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GferP56213 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GferP56213 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GferP56213 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GferP56213 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GferP56213 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GferP56213 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
GferP56213 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GferP56213 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GferP56213 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GferP56213 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms