Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aqp4P55088 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms