Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PctpP53808 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PctpP53808 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PctpP53808 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PctpP53808 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PctpP53808 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PctpP53808 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PctpP53808 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PctpP53808 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PctpP53808 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PctpP53808 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PctpP53808 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PctpP53808 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PctpP53808 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PctpP53808 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PctpP53808 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PctpP53808 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PctpP53808 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PctpP53808 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PctpP53808 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PctpP53808 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PctpP53808 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PctpP53808 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PctpP53808 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PctpP53808 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PctpP53808 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PctpP53808 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PctpP53808 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PctpP53808 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PctpP53808 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PctpP53808 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PctpP53808 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PctpP53808 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PctpP53808 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PctpP53808 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PctpP53808 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PctpP53808 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PctpP53808 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PctpP53808 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PctpP53808 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PctpP53808 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PctpP53808 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PctpP53808 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PctpP53808 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PctpP53808 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PctpP53808 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PctpP53808 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PctpP53808 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PctpP53808 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PctpP53808 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PctpP53808 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PctpP53808 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PctpP53808 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PctpP53808 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PctpP53808 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PctpP53808 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PctpP53808 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PctpP53808 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PctpP53808 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PctpP53808 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PctpP53808 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PctpP53808 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PctpP53808 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PctpP53808 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PctpP53808 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PctpP53808 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PctpP53808 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PctpP53808 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PctpP53808 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PctpP53808 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PctpP53808 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PctpP53808 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PctpP53808 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PctpP53808 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PctpP53808 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PctpP53808 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PctpP53808 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PctpP53808 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PctpP53808 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PctpP53808 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PctpP53808 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PctpP53808 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PctpP53808 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PctpP53808 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PctpP53808 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PctpP53808 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PctpP53808 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PctpP53808 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PctpP53808 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PctpP53808 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PctpP53808 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PctpP53808 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PctpP53808 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PctpP53808 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PctpP53808 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PctpP53808 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PctpP53808 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PctpP53808 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PctpP53808 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PctpP53808 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms