Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cav1P49817 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cav1P49817 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cav1P49817 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cav1P49817 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cav1P49817 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cav1P49817 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cav1P49817 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms