Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax7P47239 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax7P47239 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax7P47239 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax7P47239 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms