Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sept1P42209 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sept1P42209 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sept1P42209 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sept1P42209 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sept1P42209 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sept1P42209 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sept1P42209 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sept1P42209 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sept1P42209 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sept1P42209 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sept1P42209 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sept1P42209 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sept1P42209 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sept1P42209 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sept1P42209 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sept1P42209 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms