Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tfap2aP34056 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms