Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Saa4P31532 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Saa4P31532 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Saa4P31532 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Saa4P31532 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Saa4P31532 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Saa4P31532 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Saa4P31532 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Saa4P31532 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 500.4 ms