Protein–RNA interactions for Protein: P28740

Kif2a, Kinesin-like protein KIF2A, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif2aP28740 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kif2aP28740 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms