Protein–RNA interactions for Protein: P28660

Nckap1, Nck-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap1P28660 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nckap1P28660 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nckap1P28660 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms