Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Hoxd9P28357 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Hoxd9P28357 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Hoxd9P28357 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Hoxd9P28357 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Hoxd9P28357 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Hoxd9P28357 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Hoxd9P28357 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Hoxd9P28357 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd9P28357 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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