Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja1P23242 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja1P23242 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja1P23242 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja1P23242 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja1P23242 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja1P23242 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja1P23242 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja1P23242 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja1P23242 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja1P23242 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja1P23242 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja1P23242 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms