Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfaP20033 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms