Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18528 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18528 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18528 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18528 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18528 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18528 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18528 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18528 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18528 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18528 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18528 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18528 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18528 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18528 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18528 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18528 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
P18528 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18528 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18528 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18528 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18528 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18528 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18528 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18528 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
P18528 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18528 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18528 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18528 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18528 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18528 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
P18528 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18528 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18528 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18528 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18528 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18528 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18528 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18528 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18528 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18528 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18528 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18528 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18528 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18528 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18528 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18528 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18528 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18528 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18528 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18528 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18528 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18528 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18528 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18528 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18528 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18528 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18528 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18528 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18528 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18528 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18528 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18528 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18528 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18528 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18528 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18528 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
P18528 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18528 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18528 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18528 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18528 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18528 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
P18528 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
P18528 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
P18528 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
P18528 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18528 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18528 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18528 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18528 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18528 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18528 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18528 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18528 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
P18528 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18528 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18528 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18528 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18528 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18528 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18528 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18528 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18528 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18528 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18528 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18528 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18528 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18528 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18528 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms