Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa1P11477 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa1P11477 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa1P11477 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa1P11477 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa1P11477 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa1P11477 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms