Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nid1P10493 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nid1P10493 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nid1P10493 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nid1P10493 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nid1P10493 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nid1P10493 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nid1P10493 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nid1P10493 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nid1P10493 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nid1P10493 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nid1P10493 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nid1P10493 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nid1P10493 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nid1P10493 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nid1P10493 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nid1P10493 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nid1P10493 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nid1P10493 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nid1P10493 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nid1P10493 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nid1P10493 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nid1P10493 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nid1P10493 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nid1P10493 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nid1P10493 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nid1P10493 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nid1P10493 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nid1P10493 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nid1P10493 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nid1P10493 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nid1P10493 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nid1P10493 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nid1P10493 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms