Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms