Protein–RNA interactions for Protein: P06320

T-cell receptor beta chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06320 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P06320 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P06320 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P06320 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P06320 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P06320 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P06320 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P06320 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P06320 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P06320 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P06320 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P06320 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P06320 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P06320 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P06320 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P06320 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P06320 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P06320 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P06320 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P06320 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P06320 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P06320 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P06320 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P06320 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P06320 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P06320 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P06320 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P06320 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P06320 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P06320 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P06320 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P06320 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P06320 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P06320 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P06320 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P06320 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P06320 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P06320 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
P06320 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P06320 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P06320 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
P06320 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P06320 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P06320 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P06320 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P06320 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P06320 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P06320 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06320 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06320 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06320 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06320 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06320 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06320 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06320 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06320 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06320 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06320 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06320 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06320 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06320 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06320 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06320 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06320 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06320 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06320 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06320 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06320 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06320 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06320 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06320 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06320 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06320 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06320 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06320 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06320 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06320 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06320 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06320 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06320 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06320 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06320 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06320 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06320 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06320 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06320 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06320 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06320 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06320 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06320 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06320 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06320 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06320 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06320 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06320 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06320 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06320 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06320 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06320 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06320 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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