Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp1O89090 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp1O89090 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp1O89090 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp1O89090 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp1O89090 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp1O89090 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp1O89090 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp1O89090 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp1O89090 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp1O89090 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms