Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms