Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1bO70237 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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