Protein–RNA interactions for Protein: O35980

Nthl1, Endonuclease III-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nthl1O35980 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms