Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FxnO35943 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FxnO35943 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FxnO35943 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FxnO35943 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FxnO35943 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FxnO35943 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FxnO35943 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FxnO35943 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FxnO35943 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FxnO35943 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FxnO35943 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FxnO35943 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FxnO35943 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FxnO35943 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FxnO35943 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FxnO35943 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FxnO35943 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FxnO35943 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FxnO35943 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FxnO35943 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FxnO35943 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FxnO35943 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FxnO35943 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
FxnO35943 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FxnO35943 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FxnO35943 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FxnO35943 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FxnO35943 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FxnO35943 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FxnO35943 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
FxnO35943 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FxnO35943 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FxnO35943 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FxnO35943 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FxnO35943 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FxnO35943 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FxnO35943 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FxnO35943 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FxnO35943 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FxnO35943 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FxnO35943 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FxnO35943 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FxnO35943 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FxnO35943 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FxnO35943 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FxnO35943 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FxnO35943 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FxnO35943 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FxnO35943 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FxnO35943 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FxnO35943 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FxnO35943 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FxnO35943 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FxnO35943 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FxnO35943 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FxnO35943 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FxnO35943 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FxnO35943 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FxnO35943 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FxnO35943 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FxnO35943 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FxnO35943 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FxnO35943 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FxnO35943 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FxnO35943 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FxnO35943 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FxnO35943 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FxnO35943 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FxnO35943 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FxnO35943 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FxnO35943 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FxnO35943 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FxnO35943 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FxnO35943 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FxnO35943 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FxnO35943 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FxnO35943 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FxnO35943 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FxnO35943 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FxnO35943 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FxnO35943 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FxnO35943 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FxnO35943 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FxnO35943 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FxnO35943 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FxnO35943 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FxnO35943 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FxnO35943 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FxnO35943 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FxnO35943 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FxnO35943 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FxnO35943 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FxnO35943 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FxnO35943 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FxnO35943 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FxnO35943 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FxnO35943 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FxnO35943 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FxnO35943 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms