Protein–RNA interactions for Protein: O35929

Rem1, GTP-binding protein REM 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rem1O35929 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rem1O35929 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rem1O35929 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rem1O35929 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rem1O35929 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rem1O35929 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rem1O35929 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rem1O35929 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rem1O35929 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rem1O35929 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rem1O35929 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rem1O35929 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rem1O35929 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rem1O35929 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rem1O35929 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rem1O35929 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rem1O35929 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rem1O35929 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rem1O35929 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rem1O35929 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rem1O35929 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rem1O35929 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rem1O35929 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rem1O35929 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rem1O35929 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rem1O35929 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rem1O35929 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rem1O35929 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rem1O35929 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rem1O35929 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rem1O35929 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rem1O35929 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rem1O35929 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms