Protein–RNA interactions for Protein: O35609

Scamp3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp3O35609 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms