Protein–RNA interactions for Protein: O35216

Cenpa, Histone H3-like centromeric protein A, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpaO35216 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CenpaO35216 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenpaO35216 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CenpaO35216 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenpaO35216 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CenpaO35216 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CenpaO35216 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CenpaO35216 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CenpaO35216 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CenpaO35216 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CenpaO35216 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CenpaO35216 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CenpaO35216 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CenpaO35216 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CenpaO35216 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CenpaO35216 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CenpaO35216 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CenpaO35216 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CenpaO35216 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CenpaO35216 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CenpaO35216 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CenpaO35216 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CenpaO35216 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CenpaO35216 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CenpaO35216 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CenpaO35216 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CenpaO35216 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CenpaO35216 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CenpaO35216 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CenpaO35216 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CenpaO35216 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CenpaO35216 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CenpaO35216 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CenpaO35216 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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