Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casq1O09165 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casq1O09165 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Casq1O09165 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Casq1O09165 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Casq1O09165 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Casq1O09165 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Casq1O09165 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Casq1O09165 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Casq1O09165 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms