Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MsmbO08540 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MsmbO08540 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MsmbO08540 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MsmbO08540 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MsmbO08540 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MsmbO08540 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MsmbO08540 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MsmbO08540 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MsmbO08540 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms