Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Glipr1-201ENSMUST00000074805 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Olfr1511-201ENSMUST00000078171 957 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Gm13742-201ENSMUST00000118805 457 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 E130120K24Rik-201ENSMUST00000129910 556 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Milr1-203ENSMUST00000147326 1234 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Gm37154-201ENSMUST00000192266 1290 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Gm37614-201ENSMUST00000195645 210 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 2810029C07Rik-201ENSMUST00000180698 1954 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 A530006G24Rik-201ENSMUST00000152542 1331 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms