Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Herc6F2Z461 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms