Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20518E9Q548 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms