Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R4

Nkx6-2, NK6 homeobox 2, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-2D3Z4R4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-2D3Z4R4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-2D3Z4R4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-2D3Z4R4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-2D3Z4R4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-2D3Z4R4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-2D3Z4R4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-2D3Z4R4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-2D3Z4R4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-2D3Z4R4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-2D3Z4R4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-2D3Z4R4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-2D3Z4R4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-2D3Z4R4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-2D3Z4R4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-2D3Z4R4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-2D3Z4R4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-2D3Z4R4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-2D3Z4R4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-2D3Z4R4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-2D3Z4R4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-2D3Z4R4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-2D3Z4R4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-2D3Z4R4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-2D3Z4R4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-2D3Z4R4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-2D3Z4R4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-2D3Z4R4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-2D3Z4R4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-2D3Z4R4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-2D3Z4R4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-2D3Z4R4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-2D3Z4R4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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