Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms