Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3173A6NAS3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms