Protein–RNA interactions for Protein: A5YKK6

CNOT1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT1A5YKK6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT1A5YKK6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT1A5YKK6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT1A5YKK6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT1A5YKK6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT1A5YKK6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT1A5YKK6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT1A5YKK6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT1A5YKK6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT1A5YKK6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT1A5YKK6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT1A5YKK6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT1A5YKK6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT1A5YKK6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT1A5YKK6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT1A5YKK6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT1A5YKK6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT1A5YKK6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT1A5YKK6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNOT1A5YKK6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNOT1A5YKK6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CNOT1A5YKK6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNOT1A5YKK6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNOT1A5YKK6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNOT1A5YKK6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms