Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms