Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQI7

B020011L13Rik, RIKEN cDNA B020011L13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020011L13RikA0A087WQI7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms