Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
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SH3BP1Q9Y3L3 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
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SH3BP1Q9Y3L3 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
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SH3BP1Q9Y3L3 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
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SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
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SH3BP1Q9Y3L3 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
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SH3BP1Q9Y3L3 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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SH3BP1Q9Y3L3 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SH3BP1Q9Y3L3 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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